Система капиллярного электрофореза Qsep (аналог Система Bioanalyzer 2100) — это автоматическая платформа для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов, делаются в одном приборе в одну стадию.
Qsep1 — компактная 1-капиллярная система для лабораторий с небольшим потоком образцов.
Принцип работы: электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer.
- Автоматическая подача образцов — от 1 до 8;
- несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-200 образцов;
- время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
- разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
- чувствительность — от 5 пг/мкл (или 1 пг/мкл, если растворить в дд H₂O);
- объём образца — 1, 10 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
- визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО.
Технические характеристики системы Qsep1:
- связь с ПК — USB и Wi-Fi;
- источник возбуждения флуоресценции: светодиодный, 525 нм (зелёный);
- детекция флуоресценции: 590 нм;
- количество капилляров в картридже — 1;
- ток разделения — 1-8 кВ;
- габариты, Г × В × Ш, см, — 24 х 21 х 30.
Области применения Qsep:
- скрининг ПЦР-продуктов;
- генотипирование;
- количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
- анализ фрагментированности геномной ДНК;
- анализ внеклеточной ДНК;
- анализ продуктов рестриктазного расщепления;
- анализ олигонуклеотидов;
- оценка целостности РНК (RNA Quality Number);
- электрофорез белков (необходимо мечение Chromeo-P503).
Комплект поставки: прибор для капиллярного фореза Qsep1: ПО Q-Analyzer Basic, воздушный насос Qairbox, набор 1-канальных картриджей S1 и S2, выравнивающий маркер 20-1000, выравнивающий маркер 20-5000, маркер длин 15-622, маркер длин 50-3000.
Картриджи для системы капиллярного электрофореза Qsep1:
Электрофорез в Qsep происходит в картриджах разных типов, предназначенных для разделения ДНК, РНК и белков. Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов, зависит от типа прибора). В комплект поставки входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.
Standard (S2) |
High Resolution (S1) |
Kilobase (S3) |
High Sensitivity (N1) |
High Sensitivity (N3) |
RNA (R1) |
RNA (NR1) |
Protein (P2) |
|
Тип анализируемой молекулы |
ДНК |
ДНК |
ДНК |
ДНК |
ДНК |
РНК |
РНК |
Белки |
Диапазон длин разделяемых фрагментов |
10-5000 п.н. |
10-5000 п.н. |
10-50000 п.н. |
10-5000 п.н. |
10-5000 п.н. |
- |
20-6000 нт |
11-155 (до 600) кДа
|
Чувствительность |
0,1 нг/мкл (или 2 пкг/мкл в H₂O) |
0,1 нг/мкл (или 2 пкг/мкл в H₂O) |
0,1 нг/мкл (или 2 пкг/мкл в H₂O) |
5 пг/мкл (или 1 пкг/мкл в H₂O) |
20 пг/мкл (или 1 пкг/мкл в H₂O) |
5 нг/мкл (или 1 нг/мкл в H₂O) |
1 нг/мкл (или 0,2 нг/мкл в H₂O) |
0,5 нг/мкл (БСА) |
Макс. разрешение |
4-10 п.н. |
1-4 п.н. |
4-10 п.н. |
1-4 п.н. |
4-10 пн |
- |
5-8 мин. |
11-155 кДА за 3-7 мин |
Время анализа одного образца |
2-3 мин |
3-5 мин |
9-21 мин |
2-3 мин |
9-25 мин. |
5-8 мин |
||
Количество образцов (на 1 картридж) |
200 |
200 |
200 |
100 |
100 |
100 |
100 |
100 |
Область применения |
||||||||
Скрининг продуктов ПЦР |
+ |
+ |
|
|
|
|||
RFLP |
+ |
+ |
|
|||||
SNP |
|
+ |
|
|||||
Плазмидный анализ |
|
+ |
+ |
|
||||
Анализ библиотек для секвенирования |
+ |
+ |
|
|||||
Анализ геномной ДНК |
+ |
+ |
+ |
|
||||
Анализ внеклеточной ДНК |
|
+ |
|
|
||||
Анализ РНК |
|
+ |
+ |
|||||
Анализ и контроль CRISPR |
+ |
+ |
|
|
+ |
+ |
+ | |
Образцы с низкой концентрацией |
+ | + |
+ |
|||||
Замена э/ф в денатурирующих условиях |
+ |
|||||||
Оценка чистоты IgG |
+ |