Наборы, которые спасают жизни. HLA-типирование Omixon — высокая производительность, высокая скорость и низкая стоимость анализа

23.12.2024

HLA-типирование Omixon — высокая производительность, высокая скорость и низкая стоимость анализа

Заболевания системы крови — это группа патологий, которые могут угрожать жизни и здоровью как детей, так и взрослых. К таким заболеваниям относят лейкемию, некоторые разновидности лимфом, тяжелые формы апластической анемии, множественную миелому, врожденные и приобретенные иммунодефициты, аутоиммунные заболевания, злокачественные новообразования. Все эти заболевания имеют серьезные последствия и требуют ранней диагностики и эффективного лечения. В ряде случаев трансплантация костного мозга (или трансплантация гемопоэтических стволовых клеток) — это единственно возможное решение при лечении таких заболевания. А успешно проведенная трансплантация предоставляет пациентам возможность вернуться к нормальной жизни.

Ежегодно в России по официальным данным более 5 тысяч человек нуждаются в трансплантации костного мозга — из них взрослые 4214 человек, дети 900. По неофициальным данным эти цифры увеличиваются вдвое.

Выделяют два типа трансплантации в зависимости от источника трансплантируемых клеток:

  • аутологичная трансплантация костного мозга — пациент получает собственные стволовые клетки, которые были собраны заранее.
  • аллогенная трансплантация костного мозга — донорские клетки берутся у другого человека, который генетически совместим с пациентом.

При аллогенной трансплантации донорские стволовые клетки должны быть полностью или частично совместимы по генетическому признаку — антигенам гистосовместимости, отвечающим за тканевую совместимость. Различия в этих антигенах между пациентом и донором могут привести к отторжению трансплантата. Вероятность наличия среди родственников полностью совместимого донора составляет не более 25%. Если родственного донора нет, используются клетки совместимых неродственных доноров. Поиск добровольцев осуществляется анонимно в регистрах доноров костного мозга. Совместимость определяется после проведения типирования специальной группы генов системы HLA (Human Leukocyte Antigens), которая определяет генетический профиль тканей пациента и донора. HLA-система играет ключевую роль в иммунном ответе, обеспечивая различение между клетками своего организма и чужого. Необходима совместимость минимум по пяти локусам гистосовместимости: HLA — A, B, C, DRB1, DQB1.

В России проводят порядка 2 тыс. трансплантаций в год, в основном это аутологичные трансплантации, а от неродственных доноров — всего около 400 трансплантаций. Одна из причин — отсутствие совместимого донора. При этническом разнообразии и генетической вариабельности россиян, отечественная база доноров насчитывает всего 300 тыс. добровольцев. Это количество конечно же не может полностью покрыть полную потребность в трансплантациях. Для сравнения в Германии количество добровольцев насчитывает более 10,3 млн. человек, в США — более 9,6 млн, в Великобритании — 2,4 млн.

На протяжении многих лет сообщество исследователей HLA работало над созданием метода, который позволил бы точно определить последовательность генов HLA, с учетом их высокой полиморфности. Появление технологии полимерназной цепной реакции (ПЦР) в сочетании с другими методами (секвенирование по Сэнгеру, серологические методы, мультиплексный анализ) дало возможность существенно улучшить идентификацию полиморфизмов HLA, но у этих методов был и ряд ограничений, препятствующих точной расшифровке генов HLA. Был разработан и освоен метод чтения последовательности ДНК, получивший название Next Generation Sequencing (NGS, «секвенирование нового поколения») — он и открыл путь к полной и точной расшифровке генов HLA.

Метод NGS имеет две отличительные особенности:

  • выборочное секвенирование целевых фрагментов ДНК после клональной амплификации;
  • высокую пропускную способность.

HLA-типирование с помощью NGS позволяет ускорить создание регистров доноров костного мозга, поднять качество и скорость исследований, и вдвое сократить стоимость анализа.

Ситуация с донорством костного мозга в России значительно улучшается благодаря деятельности таких фондов, как Национальный регистр доноров костного мозга имени Васи Перевощикова. Создание этого фонда в 2017 году стало важным шагом в развитии системы донорства в стране, ведь от того, насколько активно проводятся типирования и пополняются регистры доноров, во многом зависит успех поиска совместимого донора для пациентов с болезнями, требующими трансплантации костного мозга.

На сегодняшний день количество зарегистрированных в Национальном РДКМ доноров составляет впечатляющие 101,3 тыс. человек. Это число свидетельствует о растущем интересе граждан к проблеме донорства и помощи людям, страдающим от сложных заболеваний крови. Каждый новый донор, который пополняет регистр, увеличивает шансы пациентов на успешное лечение.

С 2018 года было заготовлено 468 трансплантатов, и для этого россияне проявили большую готовность стать донорами. Из упомянутого количества 338 заготовок были выполнены от доноров из Российской Федерации, что подчеркивает местный вклад в систему донорства. Интересно, что среди этих заготовок 16 были направлены иностранным пациентам, что также говорит о международной солидарности и необходимости взаимопомощи в медицинских вопросах. Оставшиеся 130 заготовок были получены от зарубежных доноров.

К тому же, стоит отметить, что Национальный РДКМ обеспечивает треть всех неродственных трансплантаций в стране. Это доказывает его важность и необходимость в системе здравоохранения. С увеличением числа доноров и проводимых типирований, можно надеяться на дальнейший рост эффективности трансплантаций и улучшение качества жизни множества людей. Работа таких фондов, как Национальный РДКМ, не только предоставляет возможность спасти жизни, но и способствует развитию медицинской науки и практики в России.

Лаборатория тканевого типирования Национального РДКМ в Казани занимает одно из лидирующих положений в области типирования с использованием современных технологий секвенирования нового поколения (NGS). Руководитель лаборатории — кандидат биологических наук Елена Ильясовна Шагимарданова. Мощность лаборатории — 25 тыс. типирований за год. Для потокового типирования большого количества донорских образцов в данной лаборатории используются наборы Holotype HLA производства Omixon (регистрационное удостоверение РЗН 2024/23361 от 14.08.2024 г.). Наборы рассчитаны на анализ пяти (HLA- A, B, C, DRB1, DQB1) и семи (HLA- A, B, C, DRB1, DQA1, DQB1, DPB1) локусов гистосовместимости. Одновременно можно проанализировать до 288 образцов. На данный момент рутинно типируются пять локусов гистосовместимости, но совместимость донора и реципиента по семи и большему числу локусов, конечно, увеличивает вероятность успешной трансплантации.

Пока нет данных. Перейти в каталог
HLA 24/7
24 образца
РУ
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

  • Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
  • для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
  • исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
  • одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

  • Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
  • получение результатов менее чем за 48 часов;
  • библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

  • Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
  • наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
  • поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

  • Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
  • время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
  • два независимых алгоритма генотипирования;
  • 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
  • сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
  • глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 24/7

  • Набор Holotype HLA 24/7 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 24-луночный планшет для подготовки библиотеки;
  • один набор рассчитан на анализ 24 образцов;
  • типирование по 7 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DPB1, DQA1, DQB1 и DRB1);
  • набор Holotype HLA 24/7 может быть выполнен в одной из 4-х конфигураций, A1, A2, A3, A4, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A1 стандартная идентификация от 1 до 24, в А2 – от 25 до 48, в А3 — от 49 до 72, в А4 — от 73 до 96. Совместное использование 4-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 96 образцов;
  • ПО в комплекте;
  • наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).
HLA 96/5
96 образцов
New
РУ
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

  • Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
  • для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
  • исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
  • одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

  • Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
  • получение результатов менее чем за 48 часов;
  • библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

  • Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
  • наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
  • поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

  • Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
  • время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
  • два независимых алгоритма генотипирования;
  • 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
  • сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
  • глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 96/5

  • Набор Holotype HLA 96/5 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 96-луночный планшет для подготовки библиотеки;
  • один набор рассчитан на анализ 96 образцов;
  • типирование по 5 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DRB1, DQB1);
  • набор Holotype HLA 96/5 может быть выполнен в одной из 3-х конфигураций, A, B, C, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A стандартная идентификация от 1 до 96, в В — от 97 до 192, в С — от 193 до 288. Совместное использование 3-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 288 образцов;
  • ПО в комплекте;
  • наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).
HLA 96/7
96 образцов
New
РУ
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

  • Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
  • для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
  • исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
  • одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

  • Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
  • получение результатов менее чем за 48 часов;
  • библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

  • Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
  • наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
  • поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

  • Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
  • время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
  • два независимых алгоритма генотипирования;
  • 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
  • сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
  • глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 96/7

  • Набор Holotype HLA 96/7 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 96-луночный планшет для подготовки библиотеки;
  • один набор рассчитан на анализ 96 образцов;
  • типирование по 7 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DPB1, DQA1, DQB1 и DRB1);
  • набор Holotype HLA 96/7 может быть выполнен в одной из 3-х конфигураций, A, B, C, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A стандартная идентификация от 1 до 96, в В — от 97 до 192, в С — от 193 до 288. Совместное использование 3-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 288 образцов;
  • ПО в комплекте;
  • наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).

Представленные наборы работают на платформах NGS Illumina и GeneMind (FASTASeq 300). Реализация рабочего процесса с получением результатов занимает по времени менее 48 часов. Программное обеспечение HLA Twin обеспечивает достоверность результатов с помощью двух независимых алгоритмов консесусного и статистического генотипирования. ПО даёт возможность выявления нулевых и новых HLA аллелей.

Стать потенциальным донором костного мозга в Национальном РДКМ чтобы помочь людям, нуждающимся в трансплантации кроветворных клеток, может каждый. Основные критерии для регистрации это возраст от 18 до 45 лет и вес больше 50 кг.

Существует два основных метода регистрации в качестве донора — сдача крови или забор эпителия внутренней стороны щеки (буккальный эпителий).

Для сдачи крови на типирование вы можете обратиться в ближайшие офисы «Инвитро», «CMD» или «ДНКОМ», по Пермскому краю в лабораторию «МедЛабЭкспресс», предварительно уточнив время работы на сайте соответствующего медицинского учреждения.

Нужно будет заполнить следующие документы: анкету потенциального донора костного мозга, соглашение о вступлении в регистр доноров костного мозга, согласие на обработку и передачу персональных данных.

Если для Вас удобнее сдать образец буккального эпителия, то Вам необходимо подать заявку на набор для взятия буккального эпителия на сайте регистра. В течение месяца после заявки Вы получите уведомление о доставке заказного письма в ближайшее отделение Почты. В письме будет также анкета потенциального донора костного мозга, соглашение о вступлении в регистр доноров костного мозга, согласие на обработку персональных данных, и еще две палочки для забора буккального эпителия, инструкция по забору, конверт для обратной отправки с адресом.

Используя палочки, аккуратно соберите образец буккального эпителия согласно приложенной инструкции, далее упакуйте эти палочки и документы в предоставленный конверт и отправьте их Почтой России заказным письмом по указанному адресу.

Важный момент! Оба способа регистрации являются бесплатными!

Помните, приняв решение стать донором, Вы можете спасти чью-то жизнь!


См. также:

Вортексы
ДНК-амплификаторы "классические"
Пипетки автоматические многоканальные
ПЦР-боксы
Секвенаторы ДНК 2-го поколения NGS
Станция дозирования механическая, 96/384 канальная, M20, GenFollower
Станция дозирования механическая, 96/384 канальная, M200, GenFollower
Станции выделения НК и белков
Термостаты, термостаты-шейкеры твердотельные
Флуориметры для определения концентрации НК и белка
Центрифуги-вортексы




Ниже вы можете задать вопрос или оставить запрос в свободной форме:

Раскрыть анкету для отправки запроса

Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!