AMGene Dye v3.1 — готовый набор реагентов, предназначенный для циклического секвенирования по методу Сенгера с использованием флуоресцентно-меченых терминирующих трифосфатов. Реакция секвенирования проводится путем циклической элонгации ДНК с нуклеотид-специфическим терминированием флуоресцентными аналогами нуклеотидов. Набор представляет собой более экономичную и качественную альтернативу реагентам BigDye Terminator v3.1, Thermo Fisher.
Основные характеристики набора AMGene Dye v3.1
- 2.5X реакционную смесь набора рекомендуется разбавлять 5Х реакционным буфером в 2–8 раз (в зависимости от параметров матрицы) для достижения максимальной эффективности реакции и в целях экономии реагентов;
- для получения более воспроизводимых результатов секвенирования рекомендуется готовить реакцию в объеме 20 мкл, однако допустимо сокращение реакционного объема до 10 мкл;
- анализ флуоресцентно меченых продуктов, полученных с использованием набора AMGene Dye v3.1, следует проводить на генетических анализаторах, которые успешно прошли спектральную калибровку для набора красителей Z (BigDye v3.1 Applied Biosystems). Для проведения первоначальной спектральной калибровки прибора (или новой капиллярной сборки в случае с ABI 3500) следует использовать или матричный стандарт (BigDye v3.1 matrix standard) или стандарт для секвенирования (BigDye v3.1 sequencing standard). Дальнейшая работа с набором не требует оптимизации протоколов, используемых для работы с реагентами BigDye Terminator v3.1, настройки генетического анализатора сохраняются, дополнительные калибровки при наличии уже существующей не требуются;
- набор совместим с различными генетическими анализаторами 3130, 3500, 3730, SeqStudio, G и A16 (ГТЗ), Нанофор-05, Honor-1616.
Состав набора и условия хранения
Компонент
|
375.17.036
|
375.17.037
|
375.17.042
|
24 реакции
|
100 реакций
|
1000 реакций
|
2,5х реакционный премикс
|
192 мкл
|
800 мкл
|
8000 мкл
|
5х реакционный буфер
|
300 мкл
|
500 мкл
|
4000 мкл
|
Раствор контрольной ДНК
|
5 мкл
|
10 мкл
|
10 мкл
|
Раствор контрольного
праймера
|
5 мкл
|
10 мкл
|
10 мкл
|
Хранение компонентов набора: от -18 до -25 °С в защищенном от света месте.
Транспортирование: при температуре не выше -10 °С.
Гарантийный срок годности набора: в течении 12 месяцев с даты изготовления.